Safnafræðingar, sem sérhæfa sig í rannsóknum á smásjárbyggingu vefja, vinna oft með ýmis hættuleg efni. Þessi efni eru notuð við undirbúning, litun og varðveislu vefja og geta skapað verulega heilsufarsáhættu ef ekki er farið eftir viðeigandi öryggisreglum. Auk krabbameinsvaldandi efnisins etýlenoxíðs, sem gæti verið notað til sótthreinsunar eða afmengunar, er formaldehýð aðallega notað til vefjafestingar í vefjameinafræði sem getur valdið ertingu í augum, húð og öndunarfærum.
Langvarandi útsetning getur leitt til alvarlegri heilsufarsvandamála, þar á meðal krabbameins. Sum efni sem notuð eru til litunar, beisunar og festingar eru krabbameinsvaldandi eða eitruð ef þau eru tekin inn, innönduð eða komast í snertingu við húð. Það er afar mikilvægt að framkvæma ítarlegt áhættumat áður en hafist er handa við að bera kennsl á hugsanlegar hættur. Til að halda niðri og loftræsta hættulegar gufur og útblástur ætti að nota reykháf og að auki er nauðsynlegt að hafa nægjanlegt loftskipti í rannsóknarstofum.
Regluleg þjálfun í meðhöndlun hættulegra efna og réttri meðhöndlun og förgun líffræðilegra efna ætti að veita. Öruggar vinnuaðferðir fela í sér að tryggja að öll efni og sýni séu rétt merkt með upplýsingum um hættu. Einnig er mælt með reglulegum heilsufarsskoðunum til að fylgjast með einkennum um sjúkdóma sem tengjast váhrifum.
Með því að skilja og innleiða þessar öryggisráðstafanir geta vefjafræðingar dregið úr áhættu sem fylgir útsetningu fyrir hættulegum efnum í vinnuumhverfi sínu.